História


O jogo começa com Lan Hikari (Netto Hikari no original), um operador de NetNavis, acordando atrasado para a escola. O seu NetNavi é o MegaMan.EXE (Rockman.EXE), um programa criado especialmente para ele por seu pai. Logo no começo já se sabe quem são os inimigos, uma organização chamada de World_Three, cujo objetivo verdadeiro é destruir o mundo criado pelo avô de Lan, e tem como lider MMBN_Wily(Dr. Wily.)
Durante a aventura Lan descobre diversas coisas sobre sua familia, incluindo a verdadeira origem de Megaman.EXE, que é na verdade o irmão gêmeo de Lan, Hub (Saito no original), que morreu pouco tempo depois de nascer.
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